Prof. dr hab. Agnieszka Pollo zajmuje się kosmologią obserwacyjną i astrofizyką pozagalaktyczną. W swoich badaniach skupia się na zagadnieniach statystyki wielkoskalowej struktury Wszechświata, ewolucji galaktyk, wielowymiarowej analizy danych i astroinformatyki. Realizuje obecnie projekt Narodowego Centrum Nauki “MAESTRO” poświęcony poszukiwaniu i badaniom galaktyk o niskiej jasności powierzchniowej.
W latach 2008-2011 pełniła funkcję zastępcy kierownika, a następnie w latach 2012-2014 była kierownikiem Samodzielnego Laboratorium Instrumentów Astrofizycznych w Narodowym Centrum Badań Jądrowych. Od 2014 roku kierowała Zakładem Astrofizyki NCBJ; od 2012 roku jest profesorem NCBJ. W latach 2009-2019 była także adiunktem w Obserwatorium Astronomicznym Uniwersytetu Jagiellońskiego, a od 2019 r. jest profesorem tej uczelni. Od 16 października 2023 roku pełniła funkcję Zastępcy Dyrektora NCBJ ds. Naukowych, a od 5 kwietnia 2025 pełni obowiązki Dyrektora NCBJ.
Aktywnie współpracuje z naukowcami z różnych miejsc na świecie. Była członkiem komitetu sterującego projektu VIPERS. Kieruje polskim konsorcjum projektu LSST, a także współkieruje konsorcjum projektu POLAR-2. Ponadto jest obecnie członkiem Komitetu Astronomii Polskiej Akademii Nauk oraz reprezentuje Polskę w Komitecie Użytkowników Europejskiego Obserwatorium Południowego.
W latach 2008-2011 pełniła funkcję zastępcy kierownika, a następnie w latach 2012-2014 była kierownikiem Samodzielnego Laboratorium Instrumentów Astrofizycznych w Narodowym Centrum Badań Jądrowych. Od 2014 roku kierowała Zakładem Astrofizyki NCBJ; od 2012 roku jest profesorem NCBJ. W latach 2009-2019 była także adiunktem w Obserwatorium Astronomicznym Uniwersytetu Jagiellońskiego, a od 2019 r. jest profesorem tej uczelni. Od 16 października 2023 roku pełniła funkcję Zastępcy Dyrektora NCBJ ds. Naukowych, a od 5 kwietnia 2025 pełni obowiązki Dyrektora NCBJ.
Aktywnie współpracuje z naukowcami z różnych miejsc na świecie. Była członkiem komitetu sterującego projektu VIPERS. Kieruje polskim konsorcjum projektu LSST, a także współkieruje konsorcjum projektu POLAR-2. Ponadto jest obecnie członkiem Komitetu Astronomii Polskiej Akademii Nauk oraz reprezentuje Polskę w Komitecie Użytkowników Europejskiego Obserwatorium Południowego.